قال الباحث إسلام بحيرى: "اتباع كتب الفقه مثل كتاب الإمام البخارى وأفكاره، دون مراجعة لها، يعد تجاوزا للعقل ولا يمت للعلم ولا الدين، لأنها كتب تاريخ وتعبير عن أفكار خاصة بهؤلاء الفقهاء".
وأوضح بحيرى، خلال حواره مع الإعلامى عمرو أديب، ببرنامج "كل يوم" والمذاع على فضائية "ON E"، أن ما وجد فى صحيح البخارى بالنسبة لسنن وحديث ومنها: "لا يقتل مسلم بكافر"، إذا أخذ به و تم الاعتماد عليه، يصبح ما فعله محمود شفيق مفجر الكنيسة البطرسية صحيحا، لأن معنى الحديث الذى أخرجه البخارى، إذا قتل الذمى يصبح دمه هدر ولا يتم القصاص من قاتله، مؤكداً أن هذا الحديث خاطئ ويناقض القرآن، ولم يقله الرسول عليه الصلاة والسلام - بحسب قوله.