أفادت مصادر أن سبب الحريق الذى اندلع بقطار كفر الزيات قيام السائق بعمل مناورة لتغيير جرار والضم على عربات القطار والنقل إلى خط آخر، حيث حدث حريق بالكابل الواصل ما بين العربات، وأفاد خبراء المعمل الجنائى أن الحريق شب عرضيًا "غير عمدى" وبدايته بكوفريه التوصيلات الكهربائية.
جاء ذلك على خلفية نشوب حريق بإحدى عربات قطار (القاهرة – كفرالزيات) بمحطة كفرالزيات، أثناء قيام قائده بعمل مناورة بالجرار، والسيطرة عليه وإخماده دون إصابات، وأسفر الفحص عن نشوب الحريق عقب مغادرة الركاب للقطار.
وأعلنت الهيئة القومية لسكك حديد مصر فى بيان رسمى، أنه بعد وصول قطار 539 بالجرار رقم 2135 ركاب القاهرة - منوف - كفر الزيات محطة كفر الزيات وبعد نزول جميع الركاب على الرصيف بسلام وأصبح القطار فارغ، وأثناء تدوير الجرار للقيام بالرحلة التالية تلاحظ لناظر تصاعد ادخنة من سقف العربة الاخيرة من القطار نتيجة لحريق محدود بها.
وأضافت هيئة السكة الحديد أنه على الفور تم استخدام خراطيم الإطفاء الخاصة بالمحطة وطفايات الحريق وبمساعدة مطافى البلدية تم إخماد الحريق نهائيًا وتحرر بذلك محضر شرطة برقم 2/106 أحوال نقطة شرطة سكة حديد كفر الزيات.
وفى نفس السياق قرر المهندس أشرف رسلان رئيس الهيئة تشكيل لجنة فنية للوقوف على أسباب هذا الحريق وحصر تلفيات العربة.
كانت هيئةالسكة الحديدأعلنت وجود تأخيرات على بعض خطوط الهيئة نظرا لأعمال تجديدات وصيانة السكك وتحديث نظم الإشارات وهى كالتالي: خط القاهرة / الإسكندرية متوسط تأخيرات القطارات مدة 35 دقيقة، ثانيًا : خط القاهرة / السد العالى متوسط تأخيرات القطارات - القاهرة / أسيوط مدة 40 دقيقة، أسيوط / أسوان مدة 40 دقيقة، ثالثًا : خط بنها / بور سعيد، متوسط تأخيرات القطارات مدة 45 دقيقة، رابعًا : خط طنطا / المنصورة / دمياط، متوسط تأخيرات القطارات مدة 30 دقيقة.
واعتذرت الهيئة لجمهور المسافرين عن هذه التأخيرات بسبب التهديات فى بعض مواقع العمل بالمشروعات الحديثة الجارى تنفيذها من تجديد وصيانة السكك وتطوير المزلقانات والمحطات وتحديث نظم الاشارات ودعت المسافرين إلى اتخاذ التدابير والاستعدادات بما يتوافق مع مصالحهم وأشغالهم.