تقدمت هيئة الدفاع عن عناصر جماعة الإخوان المتهمين باقتحام مبنى محافظة سوهاج، بطعن أمام محكمة النقض برئاسة المستشار مصطفى شفيق، لإلغاء عقوبات السجن الصادرة ضدهم في القضية بمدد تتراوح بين 10 و5 سنوات.
كانت محكمة جنايات سوهاج برئاسة المستشار حمدى عبد العزيز، قضت بسجن 6 متهمين 10 سنوات، وعاقبت 5 آخرين بالسجن 5 سنوات، كما عاقبت 4 متهمين بالسجن سنة واحدة، وبراءة 12 آخرين، بعد اتهامهم باقتحام مبنى محافظة سوهاج.
ووجهت النيابة العامة للمتهمين، بأنهم فى 6 يوليو 2013 بدائرة قسم ثانى سوهاج، انضموا إلى جماعة أسست على خلاف القانون الغرض منها الدعوة إلى تعطيل أحكام الدستور والقوانين، ومنع مؤسسات الدولة من ممارسة أعمالها والاعتداء على الحرية الشخصية للمواطنين، والإضرار بالوحدة الوطنية والسلام الاجتماعى، ومحاولة اقتحام مبنى محافظة سوهاج، وترويع المواطنين، وقطع الطريق العام وتعطيل وسائل المواصلات، وتهديد الأمن والسلم الاجتماعى.