احتلت جامعة المنصورة المركز الخامس على مستوى الجامعات المصرية حسب تقييم QS لعام 2016، وحصلت الجامعة فى نفس التقييم على المركز الخامس Academic reputation ؛ المركز الأول Faculty staff with PhD ؛ المركز الثالث Papers per faculty ؛ المركز الرابع Citations per paper، و المركز الثالث web impact.
جدير بالذكر أن هذا النظام الدولى لتقييم الجامعات يعتمد على ستة مؤشرات رئيسية للتقييم والقياس، وتشمل السمعة الأكاديمية وتعطى 40%، وسمعة التوظيف للخريج وتعطى %10، ونسبة الطلاب إلى أعضاء هيئة التدريس وتعطى 20%، ونسبة الإشارة إلى بحوث لأعضاء هيئة التدريس فى المجالات العالمية وهذا يعتبر عنصرا هاماً، ويشير إلى أهمية البحوث عالمياً والمأخوذة من "نظام تومسون" وتعطى 20%، وتبادل الأكاديميين وتبادل الطلاب وتعطى نسبة 5% لكل منهما.
ويعتبر تقييم "QS" من أفضل ثلاثة أنظمة لتقييم الجامعات العالمية، وهى تايمز للتعليم العالى Times Higher" Education"، والثانى هو الترتيب الدولى للجامعات أكاديمياً "Academic Ranking of World Universities"