أصبحت مصرجزءًا من الإمبراطورية المقدونية بعد انتصار الإسكندر الأكبر على الملك الفارسى دارا الثالث فى 332 ق م، وبعد موت الإسكندر فى 323 ق م وتقسيم تركته من أقاليم بين قواده، آلت مصر لحكم بطليموس الأول "سوتير" الذى جعل من مصر مملكة مستقلة تعرف باسم دولة البطالمة.
استكمل بطليموس الأول بناء عاصمة مصر الجديدة – الإسكندرية، كما بدأ فى بناء منارة الإسكندرية وجمع كل من الكهنة المصريين والإغريق من أجل تأسيس عقيدة جديدة توحد المصريين والإغريق سوياً، وفى عهد خليفته بطلميوس الثانى ازدهرت الفنون والعلوم وتم إنشاء مكتبة الإسكندرية القديمة التى كانت أكبر مكتبات العالم القديم، ما أدى لتدفق العلماء والمفكرين الإغريق إلى مصر وزادت بها التعددية الثقافية ودمجت حضارة الإغريق الجديدة مع الحضارة المصرية القديمة.
تم إنشاء مستوطنات يونانية مختلفة فى مصر خلال العصر البطلمى لتكون مناطق مركزية رئيسية للمواطنين الإغريق الذين جاءوا إلى مصر بثقافتهم وتقاليدهم مثل "بطلمية" فى صعيد مصر و"فيلادلفيا" بالفيوم و"نقراطيس" التى كانت أول مستوطنة يونانية ومركزاً للتجارة بين المصريين واليونانيين فى الدلتا والتى أنشئت خلال العصر المتأخر، أما فى العاصمة القديمة منف قام المستوطنون اليونانيون بتأسيس مستوطنتهم حول المعبد الرئيسى لبتاح بأوائل العصر البطلمي. انتهى حكم البطالمة فى مصر نهاية مفجعة عندما هزمهم الرومان فى معركة أكتيوم 31 ق.م، مما أدى إلى انتحار الملكة كليوباترا السابعة وقتل ابنها، بطليموس قيصرون الخامس عشر.